اكتشفت أنقاض المسجد الأثري منذ بضع مئات من السنين من قبل الفريق الكويتي البولندي من علماء الآثار بقيادة الدكتور Agnieszka Pieńkowska من مركز آثار البحر المتوسط بجامعة وارسو (CAŚ UW) في جزيرة فجلاكا بالكويت. وفقًا لتقديراتهم، يأتي المبنى من أواخر الفترة الإسلامية (القرنين السادس عشر والتاسع عشر).
خلال الحفريات التي أجريت هذا العام، والتي انتهت في نهاية أبريل، عثرت البعثة الأثرية الكويتية البولندية على بقايا مبنى ضخم في الجزء الشمالي الشرقي من جزيرة فجلاك الكبيرة في الخليج الفارسي. اتضح أن يكون مسجد.
يشبه مخطط المسجد المربع الذي يبلغ طول جانبيه حوالي 20 مترًا – أبلغ CAŚ UW. يتكون المبنى من فناء كبير (حوالي 200 متر مربع) يؤدي إلى الغرفة الرئيسية بأبعاد من 17 إلى 7 أمتار. عثرت الغرفة على بقايا أربعة أعمدة كبيرة تدعم السقف.