3DGenBench — erste Vergleichsplattform für die für Zwecke der 3D-Genomik entwickelten Modelle

27.07.2022
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Ein Werkzeug für die einheitliche Bewertung von Berechnungsmodellen für die Zwecke der 3D-Genomik wurde vom International Nucleome Consortium entwickelt, an dem Prof. Dariusz Plewczyński und Mag. Ing. Mateusz Chiliński von der Fakultät für Mathematik und Informationswissenschaften der Technischen Universität Warschau (PW) beteiligt waren. 

Die räumliche Organisation des Genoms ist Gegenstand der Forschung zahlreicher Wissenschaftler, deren Entdeckungen neue Informationen liefern, aber auch weitere Fragen aufwerfen. Eine der Schwierigkeiten für die Forscher ist das Fehlen einheitlicher Methoden zum Vergleich der aus 3D-Genomik-Experimenten entwickelten Modelle, heißt es in der Mitteilung der Universität.

„3DGenBench ist die erste Online-Plattform, die Vergleiche zwischen Modellen ermöglicht, die aus verschiedenen biophysikalischen Simulationsmethoden stammen. Sie bietet Wissenschaftlern aus der ganzen Welt ein einzigartiges Instrument, um ihre Ergebnisse anhand zuverlässiger Maßstäbe zu vergleichen”, erklärt Prof. Dariusz Plewczynski.

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