La Universidad Médica de Gdańsk está en el 5,5 % de las mejores universidades del mundo según Global 2000 List by the Center for World University Rankings. La lista describe en detalle las 2000 mejores universidades de 19.788 (incluidas 40 polacas) instituciones de todo el mundo. La Universidad de Gdańsk ocupa el puesto 1087 en la clasificación general, 409 en Europa y 15 en Polonia.
La Lista Global 2000 del Center for World University Rankings se crea teniendo en cuenta las actividades de enseñanza e investigación de una unidad determinada. La suma total de puntos de clasificación consiste en los resultados en categorías individuales. Están evaluadas la calidad de la educación (el número de graduados que hayan obtenido premios y distinciones importantes por tamaño de universidad) y la empleabilidad de los graduados (el número de graduados que hayan ocupado puestos altos en grandes empresas por tamaño de universidad).