A Universidade de Gdansk é uma das 20 universidades polacas qualificadas para o programa “Iniciativa de Excelência: uma universidade de pesquisa”. O objetivo do programa é selecionar e apoiar as universidades que queiram alcançar o estatuto de uma universidade de pesquisa e competir eficazmente com os melhores centros académicos na Europa e no mundo.
As universidades no programa pontuaram mais alto na avaliação de pesquisa e ensino. Além disso, nenhum dos cursos oferecidos pelas universidades selecionadas pode ter uma avaliação negativa do Comité de Acreditação na Polónia.
A seleção de universidades de pesquisa é um dos aspetos mais importantes da reforma do ensino superior, introduzido pela nova lei sobre o ensino superior.